영농지원단의 주요 임무는 농업인과 함께 용배수로, 암거, 잠관 등 시설물 점검 정비의 실시와 용배수로, 저수지, 양배수장 주위의 풀을 베어 축산농가에 제공하고 용배수로 빈병, 폐비닐, 오물 등을 제거하여 수질오염 예방을 위한 시설물 정화 활동의 시행 및 자매결연 단체와 함께 저수지 주변 정화 활동 및 계도를 병행하는 것이다. 한국농촌공사 청송영양지사는 ‘08. 11. 10 ~ ’09. 3. 31 (5개월) 까지 매월 1회 이상 실시하여 효율적인 수리시설 관리와 과학적인 물관리를 통하여 농업인이 편안하게 농사를 지을 수 있고, 자연재해에도 소중한 재산과 생명을 보호 받을 수 있도록 정성을 다하여 농업인으로부터 신뢰 받는 공익기관으로 거듭나기 위해 노력하겠다.